banniere LOOF
   

Pedigrees enrichis avec les données génétiques

Depuis juin 2014, dans un souci toujours accru de traçabilité, il est possible d’intégrer des données génétiques de santé sur les documents généalogiques émis par le LOOF (à savoir les pedigrees – y compris RIA et RIEX –, le Registre de Filiation et les certificats d’enregistrement de généalogie pour les chats étrangers). Ceci vient compléter les données concernant l'identification génétique (« DNA ») et la certification de filiation par compatibilité génétique (« DNA comp. »), décrites sur la page Identification génétique.

Actuellement, seuls les résultats génétiques sont pris en compte. Le seul examen clinique actuellement pris en compte est le test dit « PEA » ou « BAER » qui concerne les capacités d'audition du chat (détection de la surdité), dont les fiches explicatives sont téléchargeables à la page Races > Santé > Fiches.

Il devient ainsi possible de mentionner pour chaque chat le groupe sanguin et les résultats des tests génétiques, incluant son statut au regard du test renseigné (N/N pour les chats ne portant pas la mutation, N/nom du gène pour les chats hétérozygotes, nom du gène/nom du gène pour les chats homozygotes mutés).
En ce qui concerne le groupe sanguin, le test génétique est accepté pour toutes les races sauf Angora turc, Bengal, Chausie, European shorthair, Lykoï, Ragdoll, Savannah, Sibérien, Sphynx et Toyger.


L'indication « tfn » (avec n = 1, 2, 3 ou 4) après la mutation indique que le chat est indemne de la mutation "par filiation", sans avoir été testé lui-même. Le chiffre n précise le nombre de générations à remonter au maximum pour trouver les chats effectivement testés.
Cette mention n'est portée que lorsque toutes les filiations impliquées sont certifiées compatibles par test génétique (« DNA comp. »), et dans la limite de 4 générations maximum.
Exemple :


Attention : pour des raisons de pertinence, ne sont mentionnés sur les pedigrees que les résultats des pathologies répertoriées pour la race, telles qu'elles ont été validées par le conseil scientifique du LOOF selon le tableau ci-dessous. Ce tableau est évolutif et pourra dans les années à venir être complété d'autres tests.

 

Maladies héréditaires dépistables par un test ADN commercialisé
dont le résultat peut faire l'objet d'une inscription sur les documents généalogiques du LOOF

Maladie Sigle Mode de transmission (1) Races concernées Gène Mutation testée
Anomalies crânio-faciales du Burmese BHD AR Burmese américain, Bombay ALX1 c.496delCTCTCAGGACTG
Spasticité CMS AR Devon Rex, Sphynx COLQ c.1190G>A
Gangliosidose GM1 (4) GM1 AR Havana Brown, Korat,
groupe « Siamois » (2), Thaï
GLB1 c.1448G>C
Gangliosidose GM2 GM2-K AR Korat HEXB c.39delC
Gangliosidose GM2 GM2-B AR groupe « Burmese » (3), Tonkinois HEXB c.1244-8_1250del
Glycogénose de type IV GSD IV AR Norvégien GBE1 334bp ins 5' - 6.2 kb del
Myocardiopathie hypertrophique HCM-MC AD Maine Coon MyBPC3 c.93G>C
Myocardiopathie hypertrophique HCM-R AD Ragdoll MyBPC3 c.2460C>T
Myopathie hypokalimique HK AR groupe « Burmese »(3), Tonkinois WNK4 c.2899C>T
Nudité NUDE AR Sacré de Birmanie FOXN1 c.1030_1033delCTGT
Atrophie progressive de la rétine PRA-rdAc AR Abyssin/Somali, Bengal(5), American Curl, Chausie, Cornish Rex/Californian Rex, German Rex, Havana Brown, Munchkin, Ocicat, Savannah,
groupe « Siamois » (2), Singapura, Snowshoe, Thaï, Tonkinois
CEP290 IVS50+9T>G
Polykystose rénale PKD AD Persan/Exotic, British, Burmilla, Scottish/Highland, Selkirk PKD1 c.10063C>A
Déficit en pyruvate kinase PKDef AR Abyssin/Somali, Bengal, Chausie, Mau Egyptien, LaPerm, Maine Coon, Norvégien, Savannah, Sibérien, Singapura, Toyger PKLR C.693+304G>A
Atrophie musculaire spinale SMA AR Maine Coon L1X1 (& LNPEP) 140kb del, exons 4-6

(1) AR = autosomique récessif,  AD = autosomique dominant
(2) le groupe « Siamois » inclut Siamois, Oriental, Balinais, Mandarin et Peterbald.
(3) le groupe « Burmese » inclut Burmese Anglais, Asian, Burmilla, Burmese Américain et Bombay.
(4) le test GM1 n'est plus considéré comme valide pour le groupe « Burmese » à ce jour et il ne doit donc plus être utilisé jusqu'à nouvel ordre.
(5) le test PRA-rdAc, indiqué pour le Bengal jusqu'au 1er septembre 2015, ne fait plus partie des tests conseillés pour la race car peu pertinent (une forme de PRA différente identifiée chez le Bengal sera sans doute proposée en test une fois ce dernier pleinement validé).

Le LOOF a établi un protocole avec des laboratoires afin d’apporter une garantie de fiabilité dans le processus, depuis le prélèvement jusqu’à la transmission du résultat, tout en laissant aux éleveurs un choix de laboratoires en France ou à l'étranger.
La liste des laboratoires signataires sera tenue à jour sur cette page dans le tableau ci-dessous. En cliquant sur le logo de chacun d'eux, vous pourrez accéder à leur site pour prendre connaissance des tests qu'ils réalisent, de leurs conditions et de leurs tarifs. Vous pourrez également les contacter pour obtenir un kit de prélèvement et/ou le formulaire adapté à remplir par votre vétérinaire pour l'envoi des échantillons prélevés.

Antagene
France
Antagene
Genimal
France

(laboratoire reconnu jusqu'au 10/09/2016)

Genindexe
France
Genindexe
Idexx
France
tarifs communiqués
uniquement aux vétérinaires
Labogena
France
Labogena
Laboklin
Allemagne
Laboklin
Langford
Royaume Uni
Langford
VGL, UC Davis
USA
VGL, UC Davis

(à compter du 14 janvier 2018)

Le protocole

Il repose sur les principes suivants :

Consulter le texte complet du protocole (dernière actualisation : décembre 2016) : en français et en anglais avec actualisation de l'annexe A-1 en décembre 2017 : français et anglais.

Comment procéder ?

Vous souhaitez tester les chatons d’une portée, certains d’entre eux uniquement, ou bien l'un de vos reproducteurs.

Si vous avez des questions, allez consulter la rubrique de la FAQ consacrée aux tests génétiques. Si vous n'y trouvez pas la réponse à votre question, vous pouvez nous écrire (administration@loof.asso.fr pour les questions générales, genetic@loof.asso.fr pour envoyer les scans de vos tests)

 

Retrouvez cette page via : "Eleveurs", "Tests génétiques", "Santé"

© LOOF, 2009-2018, tous crédits photos (sauf mention spécifique) www.christophe-hermeline.com

Nous sommes le 22.08.2018